مطالعه تنوع ژنتیکی ژرم پلاسم خاکشیر استان کرمان با استفاده از نشانگرهای مولکولی rapd و issr و بررسی میزان اسانس موجود درتوده های مذکور و تاثیر عصاره آن روی باکتری استرپتوکوکوس پیوژنز در مقایسه با آنتی بیوتیک های موجود

پایان نامه
  • وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی کرمان - دانشکده کشاورزی
  • نویسنده کیان آقاعباسی
  • استاد راهنما امین باقی زاده
  • سال انتشار 1390
چکیده

گیاه خاکشیر با نام علمی descurainia sophia به عنوان یک گیاه دارویی در ایران و جهان شناخته شده است.در این تحقیق با کمک نشانگرهای rapdوissr تنوع ژنتیکی ژرم پلاسم خاکشیر استان کرمان مورد ارزیابی قرارگرفت. بذرهای خاکشیر 15 رویشگاه از مناطق مختلف جمع آوری شدند.استخراج dnaاز بذر به کمک روش miniperp-ctab باکمی تغییر و افزایش در مراحل شست و شوی dna صورت گرفت. کمیت و کیفیت dnaاستخراج شده توسط دستگاه الکتروفورز و نانو دراپ اندازه گیری شد. از 20 نشانگر راپید به دلیل سرعت بالا و هزینه نسبتاً کم استفاده شد که تعداد 16نشانگر که باندهای واضح تر را در واکنش زنجیره ای پلی مراز(pcr)تولید کرده بودند به همراه 4نشانگر issrکه در آنها تفاوت باند کاملاً مشخص بود برای آنالیز مورد استفاده قرار گرفتند. از این تعداد آغازگر تعداد 146 قطعه چند شکل بدست آمد و امتیازدهی انجام شد. ماتریس صفر و یک به دست آمده با کمک نرم افزازpc ntsys- با استفاده از ضریب تشابه دایس به ماتریس فاصله تبدیل شده و سپس با استفاده ازالگوریتم میانگین فاصله(upgma) دندروگرام مربوطه رسم شد. باتوجه به نتایج حاصل، 15 منطقه انتخاب شده استان کرمان در 4 گروه مجزا قرار گرفتند. کلاستر ایجاد شده تا حدود زیادی با شرایط جغرافیای همخوانی داشت. نتایج حاصل از این تحقیق نشان داد که نشانگر های rapd و issr قدرت تمایز خوبی را به منظور تعیین تنوع ژنتیکی و روابط خویشاوندی این توده نشان داده است. در آزمایش بعدی تاثیر غلظتهای مختلف عصاره اتانولی بذر خاکشیر 4 منطقه از استان کرمان بر علیه باکتری استرپتوکوکوس پیوژنز عامل بیماری مخملک در شرایط آزمایشگاهی بررسی شد. بدین منظور دیسکهای آغشته به غلظتهای mg/ml 25، 50، 100 و 250 از عصاره اتانولی بذر خاکشیر جیرفت، باغین، رفسنجان و کوهبنان به روش خیساندن تهیه شد و با قراردادن آنها روی محیط کشت آگارخونی که باکتری استرپتوکوکوس پیوژنز در آن رشد یافته بود.اثر ممانعت کنندگی رشد این باکتری با عصاره خاکشیر در مقایسه با آنتی بیوتیکهای پنی سیلین، اریترومایسین و آموکسی سیلین در قالب طرح کاملاًتصادفی با 4 تکرار مورد ارزیابی قرارگرفت. با کمک نرم افزارsas تجزیه واریانس و آزمون دانکن در سطوح 05/0 و 01/ انجام شد و آزمون تعیین حداقل غلظت بازدارندگی رشد باکتری نیز انجام شد. نتایج نشان داد عصاره mg/ml250 جیرفت دارای بیشترین اثر ممانعت کنندگی رشد باکتری را داشت، کمترین اثر ممانعت کنندگی مربوط آنتی بیوتیک اریترومایسین بود. از بین 4عصاره مورد استفاده عصاره شهرستان جیرفت بیشترین تاثیر ممانعت کنندگی رشد باکتری راداشت اما با توجه به اینکه در غلظتهای mg/m 50، 100 و 250 همولیز کامل خون صورت گرفته نمی توان این غلظتها را برای تولید داروهای گیاهی تجویز کرد ولی غلظتmg/ml25 هیچ گونه همولیزی نشان نداد و بهترین غلظت در این تحقیق برای تولید داروهای گیاهی است و حداقل غلظت بازدارندگی رشد باکتری مربوط به غلظت mg/ml 25 بود. در ادامه این تحققیق میزان اسانس موجود در گیاه خاکشیر ده منطقه از استان کرمان مورد بررسی قرار گرفت در این آزمایش به منظوراسانسگیری از روش کلونجر یا تقطیر با آب استفاده شد. بیشترین میزان اسانس در بین نمونه های مورد آزمایش مربوط به شهرستان جیرفت و کمترین میزان اسانس مربوط به شهرستان سیرجان می باشد.

منابع مشابه

بررسی تنوع ژنتیکی و فیتوشیمیایی ژرم پلاسم کلپوره استان کرمان با استفاده از نشانگر مولکولی RAPD و روش GC/MS

کلپوره (Teucrium polium L.) گیاهیست علفی، پایا و پرشاخه که در نواحی مختلف اروپا و خاورمیانه ازجمله ایران به‌صورت وحشی می‌روید. برای بررسی تنوع ژنتیکی ژرم‌پلاسم این گیاه در استان کرمان، ابتدا با استفاده از روش CTAB استخراج DNA از 15 نمونه جمع‌آوری شده انجام شد. از 15 آغازگر RAPD برای انجام PCR استفاده شد. داده‌های بدست آمده حاصل از الکتروفورز توسط نرم‌افزار NTSYS با ضریب تشابه دایس و به‌روش UPGM...

متن کامل

مقایسه تأثیر وضعیت طاق باز و دمر بر وضعیت تنفسی نوزادان نارس مبتلا به سندرم دیسترس تنفسی حاد تحت درمان با پروتکل Insure

کچ ی هد پ ی ش مز ی هن ه و فد : ساسا د مردنس رد نامرد ي سفنت سرتس ي ظنت نادازون داح ي سکا لدابت م ي و نژ د ي سکا ي د هدوب نبرک تسا طسوت هک کبس اـه ي ناـمرد ي فلتخم ي هلمجزا لکتورپ INSURE ماجنا م ي دوش ا اذل . ي هعلاطم ن فدهاب اقم ي هس عضو ي ت اه ي ندب ي عضو رب رمد و زاب قاط ي سفنت ت ي هـب لاتـبم سراـن نادازون ردنس د م ي سفنت سرتس ي لکتورپ اب نامرد تحت داح INSURE ماجنا درگ ...

متن کامل

بررسی تنوع ژنتیکی ژرم پلاسم زیره [bunium persicum (boiss.) b. fedtsch.] استان کرمان با استفاده از نشانگرهای مولکولی rapd

bunium persicum (boiss.) b. fedtsch. یک گیاه دارویی متعلق به خانواده apiaceae (جعفری) است که به نام زیره کوهی یا زیره پارسی معروف است. در این تحقیق، تنوع ژنتیکی ژرم پلاسم زیره استان کرمان با استفاده از نشانگر مولکولی rapd مورد ارزیابی قرار گرفت. میوه های زیره پارسی از 43 رویشگاه مختلف در استان کرمان جمع آوری شد. استخراج dna به روش ctab تغییر یافته از میوه انجام شد. از 27 آغازگر تصادفی که در واک...

متن کامل

بررسی تنوع ژنتیکی ژرم پلاسم های وارداتی عدس موجود در کلکسیون دانشکدۀ کشاورزی کرج با استفاده از نشانگر مولکولی rapd

تنوع ژنتیکی، اساس موفقیت در بهبود کمیت و کیفیت گیاهان زراعی است. شناخت تنوع و پتانسیل ژنتیکی هر گونۀ گیاهی در اصلاح نباتات ضرورت دارد. در این مطالعه تنوع ژنتیکی 30 نمونه عدس متعلق به کلکسیون دانشکدۀ کشاورزی کرج با استفاده از نشانگر مولکولی rapd بررسی شد. نوارهای باندی براساس وجود (1) یا نبود باند (0) کدگذاری شد. با استفاده از 15 آغازگر از بین 50 پرایمر، 143 باند قابل امتیازدهی ایجاد شد که 137 ع...

متن کامل

مطالعه تنوع ژنتیکی گیاه ختمی با استفاده ازمارکر مولکولی rapd و بررسی میزان اسانس موجوددرتوده های مذکور و تاثیر عصاره اتانلی ریشه آن روی باکتری استرپتوکوک پیوژن در مقایسه با داروهای آنتی بیوتیکی موجود.

مقدمه ختمی یکی از مهمترین گیاهان دارویی لعاب دار و عضوی از خانواده پنیرکیان1 که از لغت یونانی malake به معنی نرم گرفته شده است، می باشد . این خانواده دارای پنج جنس به نامهای: malva ,lavatera ,althaea ,alcea و abutilon می باشد که جنس اخیر درغرب آفریقا گزارش شده است. گونه ختمی دارویی2 یکی از گیاهان شاخص تیره ختمی است. درباره نام آن: althea از لغت یونانی altho به معنی شفا دادن گرفته شده و پسوند...

ارزیابی تنوع ژنتیکی ژرم پلاسم خاکشیر تلخ با استفاده از نشانگر issr

گیاه خاکشیر تلخ، دارای خواص دارویی زیادی می­باشد. مدیریت تنوع ژنتیکی و گیاهان بومی از برنامه ­های حفاظتی ضروری و مهم هر کشوری است. در این تحقیق، تنوع ژنتیکی 33 توده از خاکشیر تلخ با نشانگر مولکولیinter simple sequence repeat (issr)  مورد بررسی قرار گرفت. در مجموع 183 مکان کروموزومی ارزیابی شده و در مجموع 1537 باند ایجاد شده و امتیازدهی شدند. 11 آغازگر issr مورد استفاده، 100درصد چند­شکلی را نشان...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی کرمان - دانشکده کشاورزی

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023